忍者神龟·崛起主要讲述了2044年的纽约,大反派朗格勾结外星恶势力试图毁灭地球,大量外星人通过神秘传送门入侵,将城市化为灰烬。忍者神龟们虽负隅顽抗仍不敌敌人攻势,死伤惨重。怀抱着忍者最强武器希望,忍者神龟们决定回到过去时空,找到开启传送门的钥匙,阻止朗格,恢复世界和平。李奥纳多的弟子凯西肩负起这一使命,他在过去时空与女记者艾普利尔奥尼尔成功接头,并和忍者神龟李奥纳多、米开朗基罗、拉斐尔、多纳太罗汇合,开启了拯救世界的行动。我们的未来,我们自己做主忍者神龟们向朗格发起了终极挑战。
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